La Fondazione Federico Zeri è un centro di ricerca e formazione specialistica nel campo della Storia dell'arte.
È stata istituita nel 1999 dall'Università di Bologna con lo scopo di tutelare e divulgare l’opera e la figura di Federico Zeri, conservare e valorizzare la Biblioteca d’arte (46.000 volumi, 37.000 cataloghi d'asta) e la Fototeca dello studioso (290.000 fotografie di opere d'arte).
La Fondazione ha intrapreso un innovativo progetto per la catalogazione informatizzata e la messa online dei nuclei più significativi della fototeca. Il database online della Fototeca Zeri è oggi considerato il più importante repertorio sull'arte italiana presente nel web con oltre 150.000 immagini consultabili gratuitamente sul sito.
La Fondazione promuove inoltre giornate di studio, convegni, pubblicazioni scientifiche e mostre, oltre a conferenze e incontri aperti al pubblico. Organizza corsi e seminari di formazione specialistica rivolti a studiosi e studenti.